Le département  de génie civil et d'hydraulique existait depuis la création de l'institut d'hydraulique des INES  de Biskra (décret n°84-254 du 15/08/1984).

Le département dépend de la faculté des sciences et de la technologie et  a opté pour une politique de diversification afin d'élargir son champ de formation. Durant les années d'expérience, acquise grâce à son staff de formation de rang magistral, il a pu former 814 ingénieurs d'état en hydraulique et 1102 ingénieurs d'état en  génie civil et  des centaines de DEUA dans les deux filières.

Dans les domaines ciblés par cette filière les étudiants acquièrent des compétences de mesure et de diagnostic, de modélisation et simulation, de conception et d'exploitation, dans les domaines de l'hydraulique, et du  génie civil.
En particulier ils savent :

• - instrumenter et diagnostiquer le fonctionnement des réseaux hydrauliques et des hydrosystèmes (bassins versants, réseaux urbains, nappes, rivières, littoral et estuaires ...)
• - concevoir et dimensionner les chaînes de traitement des effluents liquides.
• - modéliser les écoulements de surface et souterrains et simuler avec des outils numériques, statistiques et stochastiques ces phénomènes.
• - Concevoir des ouvrages d'art, des routes et toute construction civile et industrielle.
• - modéliser le comportement mécanique des géomatériaux et des ouvrages de génie civil
• - concevoir et dimensionner les ouvrages associés à l'hydraulique (digues, barrages, stations de pompage ....), anticiper et prévoir pour gérer leur exploitation.

La  formation au sein du département fortement adossée à la recherche, grâce à des laboratoires de recherche de renommée nationale et internationale. C'est là un des fondements du département.Cette dynamique s'appuie sur un exceptionnel pôle de recherche national. En outre, le département est ouvert sur des partenaires socio-économiques dans le domaine de l'eau et du génie civil.